强烈的地震造成灾区人员伤亡惨重，随着气温攀升，极易导致传染病暴发流行。地震发生后，军事医学科学院先后派出了由院士、专家、教授、卫生防疫技术人员６０余人组成的卫生防疫救援队，携带数辆卫生防疫车和大批卫生防疫药品制剂，深入到汶川映秀镇等地相继展开了一系列卫生防疫作业。为拓展防疫区域，他们还及时为１万余名官兵讲解传授消杀灭等防疫技能。

    汶川灾区卫生防疫作业数据表明，军事医学科学院卫生防疫队开展的卫生防疫作业面积达３５万平方米；喷洒药物２万余公斤；卫生健康教育人数３万余人；消毒处理厕所、污水坑、垃圾点２００余个；调查保护饮用水源地２０余处；心理应激干预２万余人次，流行病学调查５万人次。