据报道，毛治国表示，“交通部”未来不是“建设部”，他希望打破过去所谓的“建设为主”的迷思，因为目前台湾地区的大经大纬的建设项目都已经做好，将来需要的是不同运具之间的整合，特别是信息通讯功能的导入，提升运输系统的智能化，提高服务质量，他也期许能够找一两个建设案，做出真正的模范BOT，引进民间，破除BOT失败弊端的迷思。

    毛治国说，上任之后第一要务就是推动两岸包机相关业务，并开放大陆观光客来台，他希望除了走马看花的观光客之外，也能够让台湾慢慢成为“处处都可观光”的境界。他透露，新的“执政团队”正在提出追加减预算，将会有配套措施在其中，其中也包括一些交通议题的前瞻规划。

    针对苏花高速公路兴建，毛治国认为是长期议题，短期内必须透过轨道运输，双管齐下解决东部交通问题。有关台铁的亏损问题，毛治国大胆的提出“车路分离”的“台北捷运”模式，希望能够帮助台铁脱困。