有关专家认为，美军在非洲建立司令部是为了掠夺非洲国家资源。

    美国《基督教科学箴言报》５月１６日报道，美国去年１０月宣布成立非洲司令部，其驻地暂时设在德国斯图加特。此后，美国一直在非洲为该司令部选址，从西非的利比里亚到几内亚湾的圣多美和普林西比，美军相关人员倒是考察了不少地方。总统布什今年２月访问非洲时也进行了相关游说。然而，非洲国家始终怀疑美国的动机，纷纷抵制。在这种情况下，一位要求匿名的五角大楼官员说，国防部最终放弃了将非洲司令部设在非洲的计划，而准备将该司令部或者固定设在德国斯图加特，或干脆迁到美国东海岸某地。

    《基督教科学箴言报》的文章说，美国国防部长盖茨去年２月宣布，美国将在北方司令部、太平洋司令部、中央司令部、欧洲司令部和南方司令部之外，增设非洲司令部，主管非洲事务。当时舆论认为，这反映了非洲在美国反恐、能源等方面的战略地位日益突出。

    据了解，美国之前在非洲的军事行动一直由欧洲、中央和太平洋三大司令部共管。在曾经饱受西方殖民统治的非洲各国看来，美军如此急于涉足非洲，名义上是为了“反恐战争”与“安保合作”的需要，真实目的则可能是控制石油等战略资源，监视其他国家在非洲的活动，并隐藏着干涉非洲国家内部事务的潜在危险。

    但对于美军非洲司令部的设立，五角大楼一直宣称，这支将于２００８年９月正式启动的新综合部队的主要任务，除了包括在非洲展开军事作战以外，还应包括搜集反恐情报和帮助非洲各国进行军事训练等，为了制止纷争、构筑和平，把重点放在人道主义援助上。“我们将合并其他活动在非洲的美国非军事机构，实现各个机构的安全功能一体化，以使该司令部运行更高效，能够发挥更综合的职能。”美军非洲司令部的一名发言人曾这样描述。